Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 SCN5A-204ENST00000414099 8303 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 FYCO1-201ENST00000296137 8504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 SCD-201ENST00000370355 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 ABCC5-205ENST00000427120 4697 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 MRPS5P4-201ENST00000592830 325 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 RYR1-202ENST00000359596 15117 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 NLRC5-203ENST00000436936 6724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC245047.1-201ENST00000433276 873 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC130456.6-201ENST00000623745 765 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 ZMYM3-201ENST00000314425 5536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 FUT10-206ENST00000518672 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 NUP214-203ENST00000451030 5021 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 TNC-201ENST00000341037 6786 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 PCDH12-201ENST00000231484 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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LAMA3Q16787 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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LAMA3Q16787 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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LAMA3Q16787 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 FAM13A-202ENST00000395002 4945 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 PGPEP1-202ENST00000269919 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 LRRC37A-202ENST00000393465 4997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 KIAA1644-201ENST00000381176 6751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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