Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 ADGRA3-209ENST00000508133 1572 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FSCN1Q16658 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.9 ms