Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 DNASE1L3-201ENST00000394549 1294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 RN7SKP39-201ENST00000410773 322 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 SETP22-201ENST00000412243 957 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AL357143.1-201ENST00000457239 934 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 LINC01396-201ENST00000609099 527 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF56Q15929 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.5 ms