Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC092683.1-202ENST00000620023 754 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC159540.2-201ENST00000621110 754 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 MYPN-201ENST00000354393 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 PTPRB-209ENST00000550857 5839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 MFSD8-218ENST00000641186 4448 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 NLGN4Y-203ENST00000382868 5338 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 ZNF827-203ENST00000508784 7463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC139272.1-201ENST00000505516 640 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms