Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ZMYM3-205ENST00000373984 5253 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 OR2D3-201ENST00000317834 1070 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 RNA5SP349-201ENST00000363743 109 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 BPIFA1-202ENST00000375413 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 OCM-202ENST00000416608 623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC073583.1-201ENST00000447553 400 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AL031727.1-201ENST00000457263 455 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 LINC02016-201ENST00000488425 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 PRR5L-209ENST00000527487 740 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 BRWD1P2-201ENST00000546823 340 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC055716.3-201ENST00000547533 761 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 NUPL2-212ENST00000548367 249 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 SOD1P2-201ENST00000563903 451 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC009237.16-201ENST00000612987 506 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 CCDC163-207ENST00000629482 953 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AL157371.2-201ENST00000637813 480 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 TUBA1C-210ENST00000639419 1075 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 BPNT1-203ENST00000414869 2357 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 NLGN4X-208ENST00000538097 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 CSNK2A1-202ENST00000349736 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 TARID-209ENST00000630119 4294 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 ZNF469-202ENST00000565624 13279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 STRADA-230ENST00000638702 2140 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 POU2F3-201ENST00000260264 2903 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AF254983.1-201ENST00000612267 3336 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AL451074.2-201ENST00000423121 2150 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 PAX6-231ENST00000606377 6901 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 CTNNA1-243ENST00000540387 2684 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 BLOC1S6-218ENST00000568816 4013 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 METAP2-202ENST00000323666 3601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 CCDC33-203ENST00000398814 2787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 MCM3-207ENST00000616552 3208 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 DNAJC16-203ENST00000375849 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 TARS-202ENST00000455217 2523 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 CLIP1-202ENST00000358808 5880 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 LINC00467-201ENST00000423222 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 ZKSCAN1-206ENST00000620510 9192 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 ANAPC16-204ENST00000615507 3100 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 VIL1-201ENST00000248444 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 SSFA2-203ENST00000409136 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 SVILP1-201ENST00000422642 2676 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 ITIH5-202ENST00000397146 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 ZNF41-201ENST00000313116 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 OR7G3-201ENST00000305444 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 IGFL3-201ENST00000341415 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 MXI1-204ENST00000369612 879 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 IGLV3-25-201ENST00000390305 380 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC105265.1-201ENST00000479379 179 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 RN7SL291P-201ENST00000487916 289 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 RN7SL482P-201ENST00000487928 298 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AP003064.1-201ENST00000526045 590 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AP003122.1-201ENST00000527402 755 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC105219.3-201ENST00000527579 374 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC018410.1-202ENST00000545474 492 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC025280.1-201ENST00000562393 260 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 FRG2KP-201ENST00000565692 971 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC092114.1-201ENST00000567227 532 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC024267.6-202ENST00000579187 1103 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AP005328.1-202ENST00000580781 776 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 RN7SL731P-201ENST00000584329 293 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AF038458.3-201ENST00000592518 500 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC004840.2-201ENST00000603368 285 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC004839.1-201ENST00000610269 501 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 BSNDP1-201ENST00000613026 367 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 HIST1H2BM-201ENST00000621112 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AP000720.2-201ENST00000623429 769 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 FP236315.1-201ENST00000623723 457 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 LAMTOR5-AS1-236ENST00000626261 464 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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