Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 CRYAB-207ENST00000527950 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AMBN-203ENST00000613447 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 MUM1L1-201ENST00000337685 4308 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SNORA70G-201ENST00000383923 142 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 VWC2L-IT1-201ENST00000416430 467 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 CLDN34-201ENST00000445307 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 PSMA6P2-201ENST00000457574 686 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC004448.4-210ENST00000610229 833 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
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