Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 LINC01762-205ENST00000437308 539 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 GLYAT-203ENST00000529732 1070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC006120.1-201ENST00000579375 546 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 PDE4DIP-241ENST00000616206 874 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 JAKMIP2-AS1-202ENST00000627433 831 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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IFT88Q13099 AL731684.1-201ENST00000415530 439 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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IFT88Q13099 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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IFT88Q13099 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL031429.2-201ENST00000602605 649 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 DNASE1L3-201ENST00000394549 1294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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