Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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TRAF1Q13077 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
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TRAF1Q13077 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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TRAF1Q13077 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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TRAF1Q13077 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
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TRAF1Q13077 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
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TRAF1Q13077 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
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TRAF1Q13077 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
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