Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 CCDC150P1-201ENST00000537123 2215 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC018845.1-201ENST00000564193 744 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AL591222.2-201ENST00000604443 754 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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PGGT1BP53609 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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PGGT1BP53609 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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PGGT1BP53609 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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