Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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CENPFP49454 SEMA6D-203ENST00000355997 5908 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 COL6A6-201ENST00000358511 9581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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CENPFP49454 RPEL1-201ENST00000441178 2130 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CENPFP49454 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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CENPFP49454 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CENPFP49454 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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CENPFP49454 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CENPFP49454 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CENPFP49454 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CENPFP49454 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CENPFP49454 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CENPFP49454 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CENPFP49454 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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