Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.4 ms