Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC074386.1-206ENST00000487102 761 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
APOBEC1P41238 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
APOBEC1P41238 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
APOBEC1P41238 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
APOBEC1P41238 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
APOBEC1P41238 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
APOBEC1P41238 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
APOBEC1P41238 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOBEC1P41238 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOBEC1P41238 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
APOBEC1P41238 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOBEC1P41238 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOBEC1P41238 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOBEC1P41238 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOBEC1P41238 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOBEC1P41238 AC007278.1-201ENST00000450893 1327 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms