Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 RN7SL664P-201ENST00000584239 305 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC015802.4-202ENST00000591967 474 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 LINC00444-201ENST00000435617 215 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 CADM2-AS2-201ENST00000467225 768 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AP002026.1-204ENST00000506454 749 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 INO80-AS1-202ENST00000560178 444 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC068152.1-202ENST00000571901 808 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 FRG2MP-201ENST00000613317 856 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC018793.5-201ENST00000640302 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AL121917.1-202ENST00000424434 367 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AL162724.2-201ENST00000426157 308 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 LINC00271-203ENST00000438618 1202 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 SNX18P9-201ENST00000440580 835 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 PRKAR1AP1-201ENST00000441422 1162 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms