Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
ZBED1O96006 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms