Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC008629.3-201ENST00000505786 586 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC226119.2-201ENST00000513501 530 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 PGAM1P8-201ENST00000526979 453 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC079031.2-201ENST00000537742 615 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC069235.1-202ENST00000545535 540 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC009997.1-201ENST00000557862 129 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 SAXO2-204ENST00000565432 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 MIR8075-201ENST00000614354 80 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 KRTAP7-1-201ENST00000621162 721 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 HUS1-201ENST00000258774 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 GBP7-201ENST00000294671 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 INHBA-AS1-201ENST00000415848 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF587B-201ENST00000442832 3339 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 ZMYND11-216ENST00000602682 1687 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 COPG1-201ENST00000314797 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 PPARG-201ENST00000287820 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 MITF-202ENST00000314589 1993 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 CASP12-201ENST00000375726 1306 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC104078.1-201ENST00000499292 1448 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 SLC16A1P1-201ENST00000486743 1510 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AL512504.2-201ENST00000445455 1909 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 ERCC8-201ENST00000265038 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRF2-201ENST00000296862 2127 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AL049697.1-201ENST00000507897 2301 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC37A2-201ENST00000333412 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 SMR3A-201ENST00000226460 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP141-201ENST00000364543 120 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 MIR146B-201ENST00000365699 73 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 IGLV11-55-201ENST00000390286 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC084880.1-201ENST00000392530 545 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC009319.1-201ENST00000411493 754 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 OR4A8-201ENST00000418689 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC111200.2-201ENST00000418877 505 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AL451081.2-201ENST00000448115 933 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 PAX8-AS1-208ENST00000456685 1207 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL706P-201ENST00000460079 292 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL685P-201ENST00000476271 298 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 FTH1P4-201ENST00000480365 553 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC009269.1-203ENST00000496414 828 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC104123.1-202ENST00000511775 581 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC060765.1-202ENST00000518367 257 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 PSAT1P1-201ENST00000518968 1106 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC003991.2-201ENST00000520993 576 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 IGLV7-35-201ENST00000523314 340 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00678-201ENST00000527083 786 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC027779.1-201ENST00000530492 516 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRJ-AS1-201ENST00000533964 301 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AP002991.1-201ENST00000539305 574 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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