Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 TPPP2-201ENST00000321760 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 KLRG1-202ENST00000356986 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 AL355862.1-201ENST00000412705 353 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 AL691515.2-201ENST00000414765 466 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 RPL34P19-201ENST00000415903 342 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 LINC00222-203ENST00000416890 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 RN7SL688P-201ENST00000471754 275 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 RPL5P15-201ENST00000475870 897 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 AC103974.1-201ENST00000527285 874 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 AP001994.1-201ENST00000527539 826 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 HNRNPCP8-201ENST00000528764 888 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 AC078860.1-201ENST00000546601 527 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 LINC01028-201ENST00000586373 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 ZNF431-206ENST00000599296 586 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 AC007785.3-202ENST00000601033 518 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 LINC00923-204ENST00000614972 1181 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 AC073488.7-201ENST00000633785 778 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 LOXHD1-201ENST00000300591 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 RRM2-213ENST00000641198 3431 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 LINC00208-201ENST00000304233 2150 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 PWRN1-212ENST00000569908 1435 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 WNK1-220ENST00000574564 1401 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 DAZ2-208ENST00000400493 3516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 MFSD6-201ENST00000281416 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 AC009500.1-201ENST00000420684 583 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 EEF1GP7-201ENST00000422983 703 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 LMLN-AS1-201ENST00000423460 542 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 VDAC1P2-201ENST00000423609 850 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 AC009269.1-201ENST00000470368 833 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 RN7SL751P-201ENST00000473281 284 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CEP44Q9C0F1 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms