Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 AC104447.1-201ENST00000624214 2124 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 GRAMD1B-206ENST00000529432 6266 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 XIST-206ENST00000434839 2865 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 NOTCH2-201ENST00000256646 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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LYSTQ99698 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 NSA2-205ENST00000610426 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 FAM234B-201ENST00000197268 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
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LYSTQ99698 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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LYSTQ99698 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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LYSTQ99698 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
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LYSTQ99698 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
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LYSTQ99698 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
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LYSTQ99698 NTPCR-202ENST00000366628 6311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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LYSTQ99698 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LYSTQ99698 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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