Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 PRLR-219ENST00000619676 1402 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 ZFP62-207ENST00000512132 4010 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 U3.1-201ENST00000362500 215 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 NRIR-201ENST00000366140 799 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 RPL36A-202ENST00000392994 691 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AL390840.1-201ENST00000420303 988 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 OR7E117P-201ENST00000422682 1112 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 LINC01049-201ENST00000426840 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AC009299.1-201ENST00000429684 717 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 OR5G3-201ENST00000435756 929 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AC009970.1-201ENST00000444873 432 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 TCEAL4P1-201ENST00000453620 588 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AC013429.1-201ENST00000456604 422 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 RN7SL213P-201ENST00000463482 317 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 PGBD4P1-201ENST00000473644 407 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 RPL34-204ENST00000502534 560 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AC025188.1-201ENST00000507514 600 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AL135934.1-201ENST00000527684 537 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AC084880.4-201ENST00000538405 577 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 LINC00640-201ENST00000554409 498 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 ARL17A-205ENST00000573185 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 ARL17B-206ENST00000575698 581 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 USP2-AS1-205ENST00000578923 895 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AC108451.2-201ENST00000603875 538 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 RPS28P1-201ENST00000604589 187 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AC080112.3-201ENST00000612552 880 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AL121809.2-201ENST00000613169 341 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 Metazoa_SRP.189-201ENST00000614219 303 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 MIR6732-201ENST00000619365 60 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AL590396.3-201ENST00000636334 300 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 AC018793.5-201ENST00000640302 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 LINC02511-201ENST00000505736 1668 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C16orf54Q6UWD8 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms