Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC108039.2-201ENST00000440214 359 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 RPE-213ENST00000445268 668 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC107029.1-201ENST00000484675 465 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 GLYCTK-AS1-203ENST00000493616 445 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 OR5M4P-201ENST00000529436 925 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AL161747.2-201ENST00000535893 472 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 PFDN5-214ENST00000551018 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 RNASE11-206ENST00000553849 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 SPINT1-AS1-204ENST00000568419 629 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC110079.2-202ENST00000629093 698 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AL356585.10-201ENST00000641883 123 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 TTC33-207ENST00000637375 1824 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 MTRF1-203ENST00000379480 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 WFDC8-201ENST00000289953 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC096570.1-201ENST00000419013 569 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 RNF216-IT1-201ENST00000443837 337 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 DLG5-AS1-201ENST00000449852 487 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 TUBBP11-201ENST00000472255 252 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 LINC01603-202ENST00000519557 712 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AP000880.1-201ENST00000529416 743 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AP006587.2-201ENST00000530696 493 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC087241.3-201ENST00000542076 862 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 ONECUT1-202ENST00000560699 996 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 EDRF1-AS1-205ENST00000601363 712 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154 ms