Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
USF2Q15853 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
USF2Q15853 BLNK-203ENST00000413476 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
USF2Q15853 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USF2Q15853 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
USF2Q15853 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
USF2Q15853 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USF2Q15853 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
USF2Q15853 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
USF2Q15853 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USF2Q15853 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USF2Q15853 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
USF2Q15853 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
USF2Q15853 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
USF2Q15853 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 HYPM-201ENST00000341016 501 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 RPL12P10-201ENST00000413498 498 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 AL583805.2-201ENST00000418571 486 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 GRPEL2P2-201ENST00000421856 670 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 TUBBP11-201ENST00000472255 252 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 PPP1R2P6-201ENST00000478565 588 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 AC092435.1-202ENST00000512752 518 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 HNRNPCP8-201ENST00000528764 888 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 ARL17A-205ENST00000573185 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 ARL17B-206ENST00000575698 581 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 AL391425.1-201ENST00000613658 807 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 DLST-216ENST00000626051 252 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
USF2Q15853 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
USF2Q15853 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
USF2Q15853 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
USF2Q15853 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
USF2Q15853 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
USF2Q15853 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RPL31-202ENST00000409000 641 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ARPP21-217ENST00000436702 561 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 LINC00271-203ENST00000438618 1202 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 MIR4422HG-201ENST00000451250 638 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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