Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 TMEM2-205ENST00000377066 5217 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 HLTF-201ENST00000310053 5317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 KLF7-202ENST00000412414 7954 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 WDR19-207ENST00000506503 2513 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 AP001043.1-202ENST00000380931 5027 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 TMCC1-203ENST00000432054 5631 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 DAZ1-202ENST00000405239 4421 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 CLCN5-204ENST00000376108 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 FAM186A-203ENST00000543096 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 HOOK3-201ENST00000307602 14398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 KCNA2-214ENST00000640774 6673 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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GAPVD1Q14C86 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 OR7A1P-201ENST00000601206 970 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 ZNFX1-204ENST00000396105 7371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 FLJ42393-201ENST00000623801 2270 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 TMTC1-201ENST00000256062 8805 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GAPVD1Q14C86 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 MID1-201ENST00000317552 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 PKD1L1-201ENST00000289672 9092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 CYP8B1-201ENST00000316161 3974 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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