Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 LINC00462-201ENST00000425350 962 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC073842.2-201ENST00000494221 572 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 OR4A1P-201ENST00000532342 920 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 LINC01919-201ENST00000578610 568 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 ETF1P1-206ENST00000427296 984 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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