Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AL592430.1-202ENST00000414383 1546 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms