Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 DDIT3-204ENST00000551116 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 MIR5008-201ENST00000584300 94 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC011444.4-201ENST00000586415 418 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 NDUFA3P1-201ENST00000588007 252 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC243960.3-201ENST00000599316 580 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC123788.2-201ENST00000612290 283 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 HIST1H4D-201ENST00000614247 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 PFN1P2-202ENST00000621347 397 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 ZNFX1-204ENST00000396105 7371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 SEMA4D-207ENST00000420987 4275 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 DUSP3-201ENST00000226004 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 NR2C1-202ENST00000333003 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 PRICKLE2-205ENST00000638394 9956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AL022323.3-201ENST00000623888 5388 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AL445235.1-201ENST00000431202 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 KIAA0040-201ENST00000423313 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 CYB5B-202ENST00000512062 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 KIF2C-201ENST00000372217 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 GALK2-203ENST00000544523 1950 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 ENO1P4-201ENST00000416471 1785 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 FAM120B-201ENST00000476287 5155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 METTL14-201ENST00000388822 6669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AL513548.3-201ENST00000611708 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 LINC00858-201ENST00000415469 2685 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 ZNF615-208ENST00000598071 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 LL22NC03-63E9.3-201ENST00000407120 3111 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 DIS3L-201ENST00000319194 3763 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 DOCK8-209ENST00000469391 6386 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 TRIO-214ENST00000509967 4949 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 COL28A1-201ENST00000399429 4277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 C16orf62-205ENST00000513947 2501 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 RP1-206ENST00000636932 3649 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 KIF2B-201ENST00000268919 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC021491.4-201ENST00000620769 2573 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 KIAA1958-201ENST00000337530 11775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 TPH2-201ENST00000333850 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 TXLNG-201ENST00000380122 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 NDUFS1-202ENST00000423725 2631 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 MCTP1-205ENST00000505208 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 MKNK1-AS1-201ENST00000602433 2445 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 ABL2-206ENST00000504405 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 RNU1-28P-201ENST00000383861 164 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 RNU1-27P-201ENST00000383869 164 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 RNU1-1-201ENST00000383925 164 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 RNVU1-18-201ENST00000384010 164 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 RNU1-2-201ENST00000384278 164 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 RNU1-4-201ENST00000384659 164 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 RNU1-3-201ENST00000384782 164 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC092042.2-201ENST00000417304 331 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 ZEB2-AS1-201ENST00000421083 453 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC130472.1-201ENST00000427885 309 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 NEFLP1-201ENST00000436364 984 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 ABCA9-AS1-201ENST00000458677 523 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC136424.1-201ENST00000518425 542 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 FXYD5-207ENST00000541435 898 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC073657.1-202ENST00000562063 334 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC006547.1-211ENST00000609191 828 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 U1.40-201ENST00000610976 164 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 U1.27-201ENST00000615842 164 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC068234.2-201ENST00000619646 522 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 CCDC83-202ENST00000342404 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 KIF13A-204ENST00000378826 5747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 SSBP2-201ENST00000320672 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms