Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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