Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ATG13-201ENST00000359513 4348 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PTPREP23469 VIT-202ENST00000379242 2810 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PTPREP23469 EFCAB1-201ENST00000262103 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PTPREP23469 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PTPREP23469 GOT2P1-201ENST00000440922 1309 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PTPREP23469 COPS4-201ENST00000264389 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PTPREP23469 RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 2102 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PTPREP23469 AC010680.2-201ENST00000603521 2117 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PTPREP23469 STARD5-201ENST00000302824 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PTPREP23469 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PTPREP23469 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PTPREP23469 OGDH-210ENST00000631326 4116 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PTPREP23469 MSANTD3-206ENST00000613183 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PTPREP23469 MAPK10-345ENST00000641724 2980 ntAPPRIS P2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PTPREP23469 DOCK11-202ENST00000276204 6664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PTPREP23469 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PTPREP23469 ZNF585A-202ENST00000356958 6822 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PTPREP23469 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PTPREP23469 DGKG-203ENST00000382164 3152 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PTPREP23469 KAT14-206ENST00000489634 3152 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PTPREP23469 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
PTPREP23469 LRP4-AS1-201ENST00000502049 1504 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PTPREP23469 CTNND1-232ENST00000532649 6026 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PTPREP23469 NTRK3-201ENST00000317501 3826 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PTPREP23469 KLRC1-207ENST00000544822 1600 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PTPREP23469 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PTPREP23469 NHLRC2-201ENST00000369301 11051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PTPREP23469 TMEM182-203ENST00000412401 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PTPREP23469 HCG18-238ENST00000449544 4262 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PTPREP23469 C9orf131-205ENST00000421362 3259 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PTPREP23469 OR6N2-201ENST00000339258 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PTPREP23469 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PTPREP23469 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PTPREP23469 SH3KBP1-203ENST00000379716 3819 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PTPREP23469 MTIF3-202ENST00000381120 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PTPREP23469 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
PTPREP23469 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
PTPREP23469 LINC01704-201ENST00000414848 834 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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PTPREP23469 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
PTPREP23469 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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PTPREP23469 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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PTPREP23469 ATP1A2-202ENST00000392233 3338 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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PTPREP23469 NOTCH2-207ENST00000602566 5046 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PTPREP23469 HBS1L-205ENST00000367837 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PTPREP23469 SERPIND1-201ENST00000215727 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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PTPREP23469 GUCY1A3-202ENST00000393832 4286 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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PTPREP23469 AL954650.1-201ENST00000430776 2051 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PTPREP23469 CLSTN2-AS1-201ENST00000513309 2693 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PTPREP23469 SLC17A3-203ENST00000361703 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PTPREP23469 IQUB-201ENST00000324698 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AL139811.2-201ENST00000373465 1630 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 IL5RA-206ENST00000430514 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 ZNF200-201ENST00000396868 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 PGR-202ENST00000325455 13748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 EIF4BP4-201ENST00000441847 1780 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 PIGP-202ENST00000360525 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 TARS-201ENST00000265112 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AL513318.2-201ENST00000602579 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 RNA5SP149-201ENST00000364952 92 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AL391869.1-201ENST00000414581 475 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC109638.1-201ENST00000417406 326 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPREP23469 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
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