Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC009413.1-201ENST00000414823 399 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 VWC2L-IT1-201ENST00000416430 467 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 LINC01384-201ENST00000422494 659 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC005550.1-201ENST00000438923 312 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AL161626.1-201ENST00000441480 490 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC138207.1-201ENST00000442757 545 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 FUNDC2P2-202ENST00000443452 493 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 SS18L2P1-201ENST00000445923 213 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC092570.2-201ENST00000452117 1143 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC093799.1-201ENST00000452411 499 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC013787.1-201ENST00000460165 307 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC009269.1-201ENST00000470368 833 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 RN7SL569P-201ENST00000494652 288 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 OR7E163P-201ENST00000505943 894 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 LINC01950-202ENST00000513273 572 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 RDH10-203ENST00000519380 978 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 SDHCP4-201ENST00000532834 510 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 OVCH1-AS1-202ENST00000550906 654 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 STX8-209ENST00000574431 731 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC012447.1-201ENST00000577914 682 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 ZNF525-206ENST00000593918 590 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 LINC01742-201ENST00000616333 628 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC244196.1-201ENST00000620569 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 PTP4A1-206ENST00000627002 447 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AL590396.3-201ENST00000636334 300 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 DTNA-205ENST00000399113 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 ZNF385B-202ENST00000409343 2750 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 LINC01994-201ENST00000496220 1808 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 IL18RAP-202ENST00000409369 1890 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 SCIN-209ENST00000519209 2660 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 SLC3A1-204ENST00000409380 2424 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 EYA1-202ENST00000340726 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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