Protein–RNA interactions for Protein: S4R3C0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S4R3C0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S4R3C0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S4R3C0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
S4R3C0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
S4R3C0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S4R3C0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S4R3C0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S4R3C0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S4R3C0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S4R3C0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S4R3C0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S4R3C0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S4R3C0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S4R3C0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
S4R3C0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S4R3C0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S4R3C0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S4R3C0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S4R3C0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S4R3C0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S4R3C0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
S4R3C0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S4R3C0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S4R3C0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S4R3C0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S4R3C0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S4R3C0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S4R3C0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S4R3C0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
S4R3C0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S4R3C0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
S4R3C0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
S4R3C0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
S4R3C0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S4R3C0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S4R3C0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
S4R3C0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S4R3C0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S4R3C0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S4R3C0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S4R3C0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
S4R3C0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
S4R3C0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
S4R3C0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S4R3C0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
S4R3C0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S4R3C0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S4R3C0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S4R3C0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S4R3C0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S4R3C0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S4R3C0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S4R3C0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S4R3C0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S4R3C0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S4R3C0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S4R3C0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S4R3C0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
S4R3C0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
S4R3C0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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