Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms