Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CD2APQ9Y5K6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD2APQ9Y5K6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD2APQ9Y5K6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD2APQ9Y5K6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD2APQ9Y5K6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD2APQ9Y5K6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD2APQ9Y5K6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD2APQ9Y5K6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD2APQ9Y5K6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD2APQ9Y5K6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD2APQ9Y5K6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD2APQ9Y5K6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD2APQ9Y5K6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD2APQ9Y5K6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD2APQ9Y5K6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CD2APQ9Y5K6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD2APQ9Y5K6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD2APQ9Y5K6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD2APQ9Y5K6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD2APQ9Y5K6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD2APQ9Y5K6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD2APQ9Y5K6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD2APQ9Y5K6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD2APQ9Y5K6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CD2APQ9Y5K6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms