Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HCN4Q9Y3Q4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HCN4Q9Y3Q4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HCN4Q9Y3Q4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HCN4Q9Y3Q4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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HCN4Q9Y3Q4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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HCN4Q9Y3Q4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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