Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
THRAP3Q9Y2W1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms