Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms