Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms