Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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