Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBE1Q9UJT0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms