Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATPIF1Q9UII2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATPIF1Q9UII2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATPIF1Q9UII2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms