Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms