Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms