Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms