Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms