Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms