Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HELLSQ9NRZ9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms