Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNCQ9H7C4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms