Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms