Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms