Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
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