Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms