Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms