Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms